В рамках научного направления Институт ведет научные исследования по выяснению закономерностей функционирования экосистемы озера Байкал. Изучаются: осадки озера Байкал как непрерывная высокоразрешающая летопись палеоклиматов Восточной Сибири, механизмы ве